Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp25P57080 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms