Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms