Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdaP56389 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdaP56389 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdaP56389 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdaP56389 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdaP56389 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdaP56389 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CdaP56389 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms