Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5eP56382 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms