Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtskP55097 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtskP55097 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtskP55097 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtskP55097 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtskP55097 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtskP55097 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtskP55097 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms