Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Faf1P54731 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms