Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XpcP51612 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XpcP51612 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XpcP51612 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XpcP51612 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XpcP51612 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XpcP51612 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XpcP51612 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XpcP51612 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XpcP51612 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms