Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MipP51180 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MipP51180 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MipP51180 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MipP51180 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MipP51180 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MipP51180 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MipP51180 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MipP51180 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MipP51180 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MipP51180 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MipP51180 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MipP51180 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MipP51180 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MipP51180 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MipP51180 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MipP51180 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms