Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms