Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms