Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CitP49025 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CitP49025 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CitP49025 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CitP49025 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CitP49025 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CitP49025 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CitP49025 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms