Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms