Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tac1P41539 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms