Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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