Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms