Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms