Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola1P33609 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms