Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DcnP28654 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DcnP28654 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DcnP28654 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DcnP28654 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DcnP28654 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DcnP28654 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DcnP28654 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DcnP28654 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms