Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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