Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms