Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl3P27659 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms