Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms