Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ggta1P23336 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ggta1P23336 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ggta1P23336 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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