Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim1P20664 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms