Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP20293 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP20293 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP20293 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TP20293 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TP20293 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TP20293 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TP20293 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms