Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P20040 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P20040 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P20040 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P20040 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P20040 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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