Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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