Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgfb3P17125 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgfb3P17125 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms