Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rb1P13405 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rb1P13405 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms