Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms