Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd2P13011 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms