Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms