Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms