Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms