Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spta1P08032 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spta1P08032 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms