Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmbP04187 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms