Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms