Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtatp6P00848 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtatp6P00848 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms