Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apaf1O88879 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms