Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd160O88875 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd160O88875 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms