Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ShdO88834 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ShdO88834 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ShdO88834 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ShdO88834 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ShdO88834 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ShdO88834 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ShdO88834 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ShdO88834 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ShdO88834 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ShdO88834 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ShdO88834 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ShdO88834 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ShdO88834 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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