Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dll3O88516 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dll3O88516 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dll3O88516 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms