Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme6O88425 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms