Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms