Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

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Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtogO55225 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtogO55225 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtogO55225 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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