Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjd2O54851 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjd2O54851 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjd2O54851 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjd2O54851 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjd2O54851 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms