Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Nedd9O35177 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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