Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Q1O19441 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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H2-Q1O19441 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms