Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casq1O09165 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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