Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckarO08786 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckarO08786 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckarO08786 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckarO08786 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckarO08786 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckarO08786 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms